Špecializovaná knižnica biodiverzity je zbierka dokumentov profilovo orientovaná na problematiku biodiverzity, agrobiodiverzity, genetických zdrojov rastlín a v širšom rozsahu na oblasť genetiky a šľachtenia rastlín. Informačné zdroje v tejto kolekcii sú v tlačenej a elektronickej forme.